More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0398 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 469 aa  907    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  71.83 
 
 		 463 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  69.48 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  66.67 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  69.47 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  59.57 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  64.67 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  62.86 
 
 		 450 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  63.15 
 
 		 472 aa  484  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  62.09 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  60.79 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  60.79 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  60.79 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  61.72 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  58.33 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  55.68 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  57.73 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  55.03 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  46.46 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  45.72 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 492 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  46.1 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  46.15 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  45.45 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  44.92 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  44.52 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  44.7 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  44.7 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  46.04 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  46.04 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  44.42 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  43.09 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  45.79 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  43.34 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  45.31 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  44.02 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  45.31 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  44.52 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  45.22 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  45.35 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  43.79 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  43.34 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  45.92 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.65 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  43.24 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  43.24 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  44.82 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  43.24 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  43.02 
 
 		 442 aa  323  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  44.3 
 
 		 468 aa  323  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  43.24 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  43.24 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  43.24 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  42.89 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  43.24 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  43.66 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  43.37 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  43.72 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  45.35 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  45.58 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  43.93 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  42.83 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  41.27 
 
 		 429 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  42.34 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  41.12 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  41.12 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  42.21 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  41.07 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  42.49 
 
 		 483 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  41.49 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  39.95 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  39.91 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  42.5 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  39.81 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  38.93 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  39.44 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  38.93 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  38.93 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  38.93 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  38.93 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  38.73 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  39.44 
 
 		 429 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  38.5 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  38.5 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  37.79 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  37.79 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  35.84 
 
 		 422 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  37.12 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  36.24 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>