More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2481 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  50.41 
 
 		 648 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2481  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 620 aa  1270    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0503355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  49.76 
 
 		 659 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  51.05 
 
 		 651 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  50.81 
 
 		 648 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  43.94 
 
 		 631 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  43.36 
 
 		 650 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  43.04 
 
 		 650 aa  538  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  45.19 
 
 		 661 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  42.97 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  44.7 
 
 		 652 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  42.88 
 
 		 632 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  42.72 
 
 		 632 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  44.01 
 
 		 660 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  44.57 
 
 		 656 aa  522  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  44.3 
 
 		 649 aa  523  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  45.7 
 
 		 656 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  44.32 
 
 		 638 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  41.56 
 
 		 653 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  42.69 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  42.69 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  42.09 
 
 		 664 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  43.95 
 
 		 652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  45.37 
 
 		 667 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  42.72 
 
 		 649 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  46.11 
 
 		 666 aa  512  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  43.98 
 
 		 657 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  42.28 
 
 		 666 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  43.82 
 
 		 656 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  43.34 
 
 		 655 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  42.86 
 
 		 643 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  42.51 
 
 		 657 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  41.82 
 
 		 644 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  46.28 
 
 		 667 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  43.94 
 
 		 657 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  43.48 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  43.58 
 
 		 649 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  43.41 
 
 		 661 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  42.98 
 
 		 639 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  45.38 
 
 		 666 aa  505  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  43.07 
 
 		 649 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  41.76 
 
 		 667 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  42.77 
 
 		 658 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  41.27 
 
 		 667 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  41.07 
 
 		 653 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  42.79 
 
 		 629 aa  502  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  42.93 
 
 		 664 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  44.26 
 
 		 655 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  44.73 
 
 		 661 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  43.46 
 
 		 658 aa  504  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  44.93 
 
 		 668 aa  503  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  45.88 
 
 		 670 aa  501  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 629 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  45.07 
 
 		 656 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  44.18 
 
 		 644 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  42.44 
 
 		 664 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  45 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  42.65 
 
 		 663 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  41.6 
 
 		 667 aa  498  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  42.9 
 
 		 655 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  42.74 
 
 		 655 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  42.7 
 
 		 660 aa  495  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  42.14 
 
 		 700 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  42.39 
 
 		 658 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  42.86 
 
 		 656 aa  495  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  41.98 
 
 		 658 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  44.12 
 
 		 651 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  41.81 
 
 		 658 aa  492  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  42.39 
 
 		 657 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  43.02 
 
 		 657 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  43.01 
 
 		 638 aa  489  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 664 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 663 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  41.75 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  40.65 
 
 		 625 aa  487  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  42.6 
 
 		 649 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  40.94 
 
 		 660 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  42.53 
 
 		 629 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  40.29 
 
 		 660 aa  488  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  42.56 
 
 		 657 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  42.97 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  39.81 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  40.78 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  45.28 
 
 		 654 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  41.01 
 
 		 632 aa  485  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  41.48 
 
 		 655 aa  482  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  41.1 
 
 		 670 aa  485  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  43.06 
 
 		 650 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  42.88 
 
 		 715 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  42.28 
 
 		 666 aa  481  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.95 
 
 		 648 aa  481  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3167  acetate/CoA ligase  41.47 
 
 		 658 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.678414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  41.94 
 
 		 657 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  40.45 
 
 		 660 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  43.26 
 
 		 653 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  42.79 
 
 		 654 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  42.64 
 
 		 653 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  41.24 
 
 		 652 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  43.11 
 
 		 663 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  43.32 
 
 		 667 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>