49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2420 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 149 aa  313  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  73.1 
 
 		 148 aa  215  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  59.15 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  57.55 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  36.88 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  34.35 
 
 		 157 aa  84.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  36.92 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  40.98 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  31.11 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  29.86 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  31.11 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  36.72 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  36.72 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  33.57 
 
 		 183 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  27.97 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  34.53 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  29.86 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.52 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  33.77 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  37.5 
 
 		 327 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  34.26 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  35.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  28.47 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  32.14 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  30.09 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  27.37 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  31.75 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  31.21 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  29.2 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  28.15 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  26.92 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  29.9 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2625  C_GCAxxG_C_C family protein  34.43 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  31.37 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  28.99 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  26.55 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  39.45 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  30.23 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  22.88 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  35.07 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  24.8 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  25.98 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  24.18 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  25.98 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  25.71 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  37.33 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  26.6 
 
 		 148 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  24.8 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  28.44 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>