30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1313 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  297  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  48.65 
 
 
147 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  48.97 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  46.53 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  46.81 
 
 
152 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  46.32 
 
 
149 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  44.9 
 
 
145 aa  120  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  48.65 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  44.06 
 
 
146 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  40.69 
 
 
148 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  40.27 
 
 
150 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  36.92 
 
 
165 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  31.97 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  35.92 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  39.6 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  28.71 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  39.39 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  27.03 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  25.71 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  24.29 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.71 
 
 
153 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  25.45 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  25.86 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  30.95 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 
146 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>