35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1471 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
148 aa  307  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  38.36 
 
 
150 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  36.88 
 
 
151 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  34.25 
 
 
152 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  37.78 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  32.19 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  31.29 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  35.37 
 
 
146 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  34.67 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  34.72 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  32.41 
 
 
148 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  31.97 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  26.71 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  32.86 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  29.58 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  31.78 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  32.84 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  29.91 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  26.02 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  28.04 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  30.91 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  28.15 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  26.4 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  27.27 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  29.81 
 
 
156 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  26.6 
 
 
149 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  29.03 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  27.17 
 
 
257 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  27.82 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>