19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1578 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  58.67 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  42.38 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  42.07 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  41.38 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  39.73 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  40.56 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  38.67 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  39.6 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  35.33 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  32.19 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  34.33 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  39.39 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  28.85 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  26.61 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>