20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0638 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  310  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  38.56 
 
 
151 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  38.31 
 
 
150 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  37.25 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  39.47 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  39.58 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  36.84 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  35.76 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  40.94 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  34.72 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  36.77 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  37.66 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  35.92 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  34.53 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  26.81 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  34.15 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  29.41 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>