45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1199 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
160 aa  332  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  60.56 
 
 
153 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  51.09 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  55 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  46.48 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  38.17 
 
 
142 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  37.5 
 
 
257 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  34.78 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  34.78 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  41.35 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  36.23 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  31.11 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  32.86 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  37.04 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  37.04 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  32.56 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  30.83 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  36.54 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  30.61 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  32.81 
 
 
164 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  30.47 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  33.96 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  27.04 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  30.43 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  29.13 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  28.04 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  28.81 
 
 
146 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  28.16 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  26.67 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  34.18 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  27.27 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  31.45 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  39.39 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  34.78 
 
 
143 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  25.93 
 
 
134 aa  43.9  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  25.81 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  25.93 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  34.15 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  33.67 
 
 
327 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  29.66 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  26.4 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  30.63 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  31.63 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  35.35 
 
 
182 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>