18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2616 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  89.58 
 
 		 145 aa  274  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  49.33 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  44.06 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  40.97 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  44.06 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  39.73 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  38.35 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  37.24 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  36.99 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  39.72 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  35.37 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  37.66 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>