19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1533 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  58.27 
 
 
147 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  52.41 
 
 
152 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  51.01 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  46.58 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  47.55 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  48.67 
 
 
151 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  48.67 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  46.53 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  44.52 
 
 
145 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  43.15 
 
 
146 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  41.61 
 
 
149 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  32.65 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  35.25 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  34.67 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  27.97 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  34.33 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>