21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1002 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  72.79 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  58.27 
 
 
149 aa  167  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  54.61 
 
 
148 aa  154  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  50 
 
 
151 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  48.65 
 
 
148 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  46.85 
 
 
150 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  44.83 
 
 
145 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  44.97 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  44.06 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  43.17 
 
 
148 aa  123  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  45.99 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  40.56 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  34.72 
 
 
148 aa  94  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  35.76 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  36.18 
 
 
154 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  35.07 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  30.56 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  24.8 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  29.89 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  28 
 
 
182 aa  40.8  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>