30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3274 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  30.56 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  29.58 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  29.45 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  37.23 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  28.17 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  27.97 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  27.37 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  26.71 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  26.09 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  30.51 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  27.82 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  26.81 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  30.77 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  25.87 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  36.62 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  26.26 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  23.21 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  36.07 
 
 
291 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  26.52 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  23.14 
 
 
154 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  23.81 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  27.47 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>