33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0395 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  293  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  68.57 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  52.71 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  64.23 
 
 		 125 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  56.8 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  38.17 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  36.88 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  33.57 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  35.38 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  38.76 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  32.58 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  37.96 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  34.72 
 
 		 257 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  28.07 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  30.5 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  31.21 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  32.79 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  35.38 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  33.59 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  36.17 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  32.69 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.59 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  27.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  31.78 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  32.58 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  27.71 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  26.51 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  31.34 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1191  C_GCAxxG_C_C family protein  29.51 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  27 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  25.9 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  27.35 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  30.95 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>