32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0224 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 161 aa  323  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  38.36 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  34.31 
 
 		 146 aa  84.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  36.89 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  31.75 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  26.98 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  29.9 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  34.58 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  32.17 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  29.85 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  32.99 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  31.31 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  26.76 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  30.47 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  29.46 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  28 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  27.54 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.19 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  26.81 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  29.27 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  25.85 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  32.71 
 
 		 327 aa  47.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  34.41 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  27.21 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  23.21 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  30.77 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  27.14 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  30.93 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  24.29 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  29.9 
 
 		 121 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  26.5 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  28.26 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>