30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2054 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  46.48 
 
 
156 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  44.14 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  48.89 
 
 
327 aa  124  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  39.29 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  39.05 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  40.71 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  32.38 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  38.26 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  37.14 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  36.19 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  35.24 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  42.27 
 
 
143 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  35.85 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  33.03 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  32.17 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  33.98 
 
 
154 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  35.64 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  30.5 
 
 
143 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  29.9 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  34.34 
 
 
153 aa  50.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  30.28 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  24.67 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  31 
 
 
153 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  30.58 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  30 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 
148 aa  42  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  23.77 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>