37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3529 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  34.31 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  37.88 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  31.11 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  32.85 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  34.75 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  38.38 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  38.38 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  33.07 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  32.23 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  35.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  32.79 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  40.62 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  30.16 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  32.03 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  32.84 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  30.07 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  30.47 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  32.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  33.96 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  31.16 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  31.07 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  25.22 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2625  C_GCAxxG_C_C family protein  29.5 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  29.63 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  24.24 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  31.07 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  30.5 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  28.16 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  26.26 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  34.94 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  32.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  30.15 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  32.65 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>