32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1719 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  97.52 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  36.72 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  36.54 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.05 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  33.01 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.05 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  33.65 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  27.45 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  30.47 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  27.52 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  30.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  30.4 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  26.61 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  31.91 
 
 		 327 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  44.26 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  27.1 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  29.51 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  29.63 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  31.33 
 
 		 257 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  30.51 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  33.7 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  30.69 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  28.06 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  26.51 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  24.77 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  27.84 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  29.9 
 
 		 161 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  25.53 
 
 		 183 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  29.41 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>