25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0554 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 183 aa  361  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  63.16 
 
 		 257 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  46.29 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  34.78 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  26.97 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  30.43 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  34.51 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  33.57 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  34.15 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  37.96 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  33.08 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  35.43 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  33.09 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  32.31 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  32.59 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  33.87 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  35.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  30.5 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  33.85 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  32.26 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  33.82 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  25.53 
 
 		 121 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  26.57 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  25.81 
 
 		 121 aa  40.8  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>