41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_44 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  100 
 
 		 148 aa  296  7e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  94.59 
 
 		 148 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  89.12 
 
 		 148 aa  268  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  41.5 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  41.01 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  42.11 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  35.11 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  35.46 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  32.19 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  35.17 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  29.79 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  31.54 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  34.45 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  31.54 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  38.38 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  35.24 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  31.96 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  35.14 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  29.13 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  36.17 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  37.4 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  31.37 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  35.42 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  32.69 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  27.54 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  29.41 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  27.52 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  29.91 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  27.52 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  36.56 
 
 		 257 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  34.26 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  25.61 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  28.16 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  29.25 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  32.26 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.97 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  27.97 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  31.78 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  34.29 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  31.91 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>