40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3143 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  46.32 
 
 
148 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  44.53 
 
 
151 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  45.99 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  46.27 
 
 
152 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  39.31 
 
 
148 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  40.29 
 
 
148 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  37.78 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  37.67 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  39.72 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  34.33 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  42.42 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  36.77 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  35.16 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  37.23 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  31.58 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  27.43 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  29.41 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  32.04 
 
 
327 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  31.31 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  26.92 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  28.43 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  27.05 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  31.45 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  27.66 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  24.18 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  36 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  25.53 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  26.42 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  27 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  25.47 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  29.79 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  23.77 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  37.33 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>