34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  100 
 
 		 143 aa  289  8e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  52 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  39.6 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  34.09 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  40.74 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  36.7 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  34.26 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  33.66 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  33.05 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  36.11 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.45 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  32.38 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  30.5 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  37.11 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  37.93 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  36.19 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  35.14 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  34.31 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  29.2 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  29.09 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  29 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  31.13 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  26.62 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  38.32 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  30.09 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  28.72 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  29.46 
 
 		 155 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  27.12 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  29.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  30.53 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  36.76 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>