32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0465 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  42.36 
 
 
146 aa  130  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  36.81 
 
 
148 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  42.36 
 
 
152 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  41.43 
 
 
148 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  42.55 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  43.66 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  36.36 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  38.93 
 
 
327 aa  104  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  35.46 
 
 
148 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  35.46 
 
 
148 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  36.17 
 
 
148 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  35.92 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  35.21 
 
 
182 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  32.84 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  38.26 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  31.73 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  32.04 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  32.38 
 
 
143 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  29.23 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  28.46 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  26.55 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  30.69 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  29.63 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  26.02 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  25.81 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  25.47 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  27.14 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  35.51 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  29.41 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  28.43 
 
 
121 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>