44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0045 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0045  redox family protein  100 
 
 		 148 aa  297  4e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  94.59 
 
 		 148 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  86.39 
 
 		 148 aa  261  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  41.5 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  36.64 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  43.61 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  40.29 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  35.46 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  32.88 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  31.91 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  35.86 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  35.29 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  31.47 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  30.87 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  39.36 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  29.85 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  34 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  38.38 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  36.19 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  34.26 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  37.4 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  34.31 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  36.46 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  29.46 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  33.87 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  34.26 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  29.13 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  28.43 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  31.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  36.56 
 
 		 257 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  28.04 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  24.77 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.86 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  27.86 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  24.77 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  32.81 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  29.57 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  30.84 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  27.18 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  26.13 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  30.56 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  25.45 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  23.81 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>