44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0041 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 148 aa  293  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  89.12 
 
 		 148 aa  268  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  86.39 
 
 		 148 aa  261  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  48.51 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  38.17 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  44.36 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  43.88 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  36.17 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  32.59 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  34.06 
 
 		 172 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  37.04 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  32.62 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  30.67 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  33.08 
 
 		 182 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  30.83 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  35.05 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  37.14 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  33.77 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  34.04 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.59 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  35.35 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  31.58 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  33.05 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  31.78 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  32.04 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  27.62 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  29.85 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  32.59 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  26.81 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  29.1 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  37.63 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  34.26 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  26.61 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  28.04 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  28.71 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  29.13 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  25.93 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  32.58 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  31.73 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  26.52 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  31.91 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  26.8 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>