33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1447 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  97.52 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  36.72 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  35.58 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  33.01 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.05 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.05 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  33.62 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  32.03 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  26.47 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  34.78 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  29.37 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  27.52 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  27.62 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  29.51 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  30.4 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  45.9 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.7 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  31.36 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  29.51 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  27.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  34.74 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  27.05 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  28.78 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  29.29 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  30.69 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  31.33 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  24.77 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  33.7 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  28.87 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  30.93 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  25.81 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  28.43 
 
 		 146 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>