16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0179 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  350  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  33.61 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  30.61 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  27.27 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  26.67 
 
 
157 aa  47.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  29.27 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  25.61 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  38.67 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  46.3 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  27.21 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  33.7 
 
 
121 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  25.93 
 
 
148 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  33.7 
 
 
121 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  34.94 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.36 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  31.87 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>