38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1476 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
157 aa  329  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  47.3 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  46.48 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  41.96 
 
 
153 aa  117  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  46.51 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  31.37 
 
 
257 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  34.35 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  32.67 
 
 
146 aa  84.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  35.53 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  26.97 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  34.23 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  34.07 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  34.11 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  31.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  33.82 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  33.09 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  33.96 
 
 
327 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2625  C_GCAxxG_C_C family protein  27.95 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  34.78 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  36 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  27.27 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  26.67 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  27.97 
 
 
249 aa  47.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  24.24 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  28.95 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  26.79 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  24.48 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  27.46 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  34.02 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0329  split soret cytochrome c precursor  26.92 
 
 
259 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  26.5 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  33.7 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0318  split soret cytochrome c precursor  26.92 
 
 
259 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  25.35 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  25.56 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>