37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4227 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 125 aa  249  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  63.71 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  65.32 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  70.73 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  65.32 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  38.97 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  34.56 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  31.91 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  34.62 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  36.5 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  33.09 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  27.86 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  32.79 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  32.26 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  34.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  28.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  34.86 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  32.74 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  30.97 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0632  hypothetical protein  37.21 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000108614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  30.53 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  34.83 
 
 		 149 aa  47.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.97 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.97 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  34.57 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  32.32 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  28.23 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  32 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  30.7 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  31.54 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  35.64 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  33.11 
 
 		 249 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>