30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3126 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  68.57 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  55.04 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  65.32 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  56.59 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  38.52 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  34.09 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  32.41 
 
 		 182 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  33.81 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  30.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  37.41 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  34.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  35.48 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  30.41 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  33.85 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  27.54 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  33.73 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  32.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  32.53 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.02 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.02 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  29.5 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  29.77 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  35.29 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  31.01 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  31.01 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  30.89 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  26.45 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  25.41 
 
 		 147 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>