32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3934 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 142 aa  284  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  76.06 
 
 		 142 aa  223  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  55.38 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  71.31 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  56.59 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  37.68 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  30.77 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  35.34 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  32.64 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  33.57 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  37.31 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  33.82 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  26.09 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  36.89 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  36.11 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  28.68 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.19 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  37.12 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  37.5 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  34.07 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  35.19 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  34.26 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.23 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.23 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  31.67 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  25.42 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  37.14 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  30.36 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  28.87 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  26.92 
 
 		 327 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>