37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1302 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
153 aa  313  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  60.56 
 
 
160 aa  185  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  45.64 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  47.26 
 
 
154 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  41.96 
 
 
157 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  30.43 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  28.97 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  32.58 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  32.61 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  30.14 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  27.97 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  29.37 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  31.62 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  27.07 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  31.88 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  27.03 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  34.26 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  26.36 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  25.56 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  28 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  33.64 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  25.22 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  31 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  29.51 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  29.27 
 
 
173 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  29.51 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  31.58 
 
 
327 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  29.35 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  32.1 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.28 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.28 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  26.8 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  27.18 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03810  split soret cytochrome c precursor  23.31 
 
 
249 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>