27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1057 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  46.29 
 
 		 183 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  42.95 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  32.86 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  32.61 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  36.03 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  31.33 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  37.41 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  35.38 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  35.07 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  39.81 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  35.07 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  36.76 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  35.09 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  32.11 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  29.45 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3126  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  31.01 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1376  hypothetical protein  35.35 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  31.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.1 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4227  C_GCAxxG_C_C family protein  34.51 
 
 		 125 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  26.09 
 
 		 161 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  29.03 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>