20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1613 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  299  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  89.58 
 
 		 146 aa  274  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  49.66 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  44.83 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  44.52 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  44.9 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  40.14 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  37.59 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  38.46 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  34.67 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  35.33 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  25.9 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  29.7 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>