19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1819 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  41.18 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  39.6 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  39.6 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  40.94 
 
 
155 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  36.18 
 
 
147 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  37.09 
 
 
152 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  37.33 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  35.33 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  34.75 
 
 
149 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  34 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  34.67 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  26.71 
 
 
148 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  35.95 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  39.6 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  31.21 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  23.18 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  28.57 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>