19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1801 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  342  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0443227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  44.7 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2616  hypothetical protein  38.35 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1613  hypothetical protein  37.59 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1558  hypothetical protein  42.22 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0950957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3543  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  39.39 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1812  C_GCAxxG_C_C family protein  37.69 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  36.92 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1002  hypothetical protein  35.07 
 
 		 147 aa  88.2  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1533  hypothetical protein  35.25 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  35.16 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0224  hypothetical protein  35.45 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  34.53 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  32.86 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1547  hypothetical protein  29.71 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1819  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  30.51 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  27.35 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>