More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2411 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 132 aa  273  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.48 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.48 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.27 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.31 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  34.59 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.6 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.57 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.62 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.37 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.06 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  40.15 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.79 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.02 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.82 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.21 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.21 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  40.15 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.82 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.94 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.94 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.38 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.08 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.03 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.2 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  32.31 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.71 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.19 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.17 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  30.95 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.54 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  34.86 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.28 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  33.88 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.99 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  32.48 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  32.73 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  27.82 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  32.73 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.73 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  33.64 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  29.93 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.23 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1356  flagellar basal body rod protein FlgB  30.7 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  30.4 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  33.94 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  29.01 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  36 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  36 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  31.53 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.71 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  26.4 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.2 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.04 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.11 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2268  flagellar basal body protein  30.94 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1557  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.371547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1709  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  30.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1674  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  41.33 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1531  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1520  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 261 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  34.69 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1741  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  34.69 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3636  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>