191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1576 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
137 aa  286  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  58.82 
 
 
136 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  55.15 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  51.47 
 
 
155 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  47.01 
 
 
136 aa  130  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.34 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.5 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  34.59 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.19 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.61 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.32 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.65 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.13 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  30 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.84 
 
 
137 aa  66.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.62 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.11 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  30.56 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  33.06 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.62 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.12 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  39.62 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.6 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  32.48 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  30.36 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  29.6 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.84 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  29.6 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.12 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.56 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  30.33 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.53 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.83 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.93 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  28 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.69 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  29.37 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.81 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.61 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  27.83 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.56 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  26.23 
 
 
136 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  31.15 
 
 
145 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  30.25 
 
 
117 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  30.25 
 
 
117 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.9 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  27.48 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  25.38 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  27.61 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.09 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  27.61 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.79 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.75 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.03 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.22 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.82 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.24 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.48 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  25 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.01 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.09 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  24.43 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>