246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2055 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  99.28 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  99.28 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  99.28 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  81.16 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  81.16 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  81.16 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  81.16 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  81.16 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  77.54 
 
 		 138 aa  224  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  76.09 
 
 		 139 aa  219  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  75.36 
 
 		 138 aa  218  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  74.64 
 
 		 138 aa  216  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  72.99 
 
 		 137 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  71.53 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  71.53 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  71.53 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  68.89 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  57.78 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  57.78 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  56.62 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  54.41 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  45.73 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  44.51 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  45.34 
 
 		 163 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.59 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  43.12 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  42.77 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  43.12 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  44.38 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  43.12 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  44.38 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  43.12 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.81 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  41.88 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.08 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.79 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.08 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.38 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  45.52 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.44 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  44.27 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  45.04 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  47.29 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.37 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  48 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  48 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  43.18 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.03 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.09 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.54 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.07 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.07 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.41 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  42.54 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.67 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.39 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  43.7 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.22 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  43.7 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  42.42 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  41.67 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.94 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  43.7 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  49.57 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.03 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.54 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.19 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.41 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  45.8 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  45.8 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  43.07 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6142  flagellar basal body protein FlgB  45.61 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  41.48 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  38.24 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.88 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  41.48 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  41.48 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  39.26 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  39.39 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>