112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1392 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 135 aa  279  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  82.96 
 
 		 135 aa  233  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  68.66 
 
 		 135 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  68.38 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  66.42 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  66.42 
 
 		 145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  67.65 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  52.21 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  47.76 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  48.2 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.19 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.17 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.59 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.33 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  29.82 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.69 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  27.19 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  28 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.62 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.06 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.53 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  32.79 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  29.06 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.74 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  31.97 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.29 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.29 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.31 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.31 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.99 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.21 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.86 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.86 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  30.17 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.66 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.38 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  25.5 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.43 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.75 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.56 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.79 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  30.89 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  30.7 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  22.73 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  27.35 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  30.7 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  36.84 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.69 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.74 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  27.59 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.34 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  37.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 137 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  26.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  26.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  27.27 
 
 		 136 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  27.73 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  38.24 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  39.34 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.01 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  37.68 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.89 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.29 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.51 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  26.05 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>