115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2235 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
133 aa  274  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  63.57 
 
 
138 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  61.15 
 
 
138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  61.87 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  54.81 
 
 
145 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  55.88 
 
 
135 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  53.73 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  51.11 
 
 
136 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  52.21 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  54.07 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  55.22 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  52.21 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  53.68 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.15 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.16 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  37.59 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  33.59 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  36 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  39.05 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  39.25 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  36.89 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  34.11 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  38.1 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  39.36 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  32.71 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  38.39 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.35 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  30.09 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  36.17 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  36.17 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  27.64 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.01 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.59 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  35.14 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  30.58 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.64 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.91 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  24.22 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  32.5 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.62 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  30.77 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  30.84 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 
144 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  33.98 
 
 
138 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  33.98 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.54 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  30.84 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  33.98 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  34.91 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  34.91 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  34.91 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  34.91 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  34.91 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.65 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.76 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  30.84 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  36.63 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.69 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.58 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  28.23 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.83 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  28.35 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.98 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  30.58 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.19 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.23 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.31 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.97 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  24.56 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.24 
 
 
134 aa  42  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  28.45 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 
135 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  29.75 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  33.67 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>