196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0427 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  33.8 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.36 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.85 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.72 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.56 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.96 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.09 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.81 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.15 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.45 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.37 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.03 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.19 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  35.25 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.51 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.88 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  31.19 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  33.67 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.61 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.71 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.72 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  32.11 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.34 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  32.11 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.9 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  34.65 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  31.63 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  31.63 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.88 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.97 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  31.63 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.91 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  33.58 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  29.17 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  33.91 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.93 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.94 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  33.86 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.93 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  31.78 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  31.78 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  26.83 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.93 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  36.05 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.2 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  31.53 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  28.44 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.06 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  27.35 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  26.92 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0169  flagellar basal body rod protein FlgB  28.07 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  26.62 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.01 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  34.86 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.52 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.08 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.71 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.71 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  26.62 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  26.62 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  26.62 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  26.92 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  25.83 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  35.14 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.61 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  26.62 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  33.94 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  26.75 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  26.75 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.48 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  33.94 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>