210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0356 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 155 aa  327  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  65.44 
 
 		 136 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  58.82 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  57.35 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  51.47 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.85 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.58 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.84 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.51 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.34 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.23 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.75 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  32.33 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  37.78 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.82 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.5 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.39 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.16 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.85 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.79 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.38 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  37.82 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.77 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  30.23 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.11 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  32.12 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.15 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.26 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  32.59 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.42 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  34.91 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.23 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.5 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.61 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.24 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  31.11 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.48 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.12 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  28.8 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.14 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  28.47 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.24 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.82 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  34.11 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.35 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  29.32 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  29.84 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  27.15 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  28.69 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.01 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  27.54 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.13 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  28.24 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.51 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  38.89 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  26.72 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  26.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  32.06 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>