222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02928 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  61.27 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  53.96 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.89 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  48.23 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  50.36 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.92 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  43.88 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  48.2 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  46.76 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  45.32 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  45.32 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2962  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1416  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3100  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2947  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.52 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  42.45 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  42.96 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  42.25 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  42.25 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.17 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  40.85 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  41.84 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  41.84 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  41.84 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  41.01 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.45 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  41.55 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  40.14 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  41.73 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.87 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.29 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  40.85 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  42.96 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  39.86 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  39.86 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  39.86 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  39.86 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  39.86 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  38.85 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.86 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  36.59 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.85 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  38.85 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.22 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.22 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.45 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  41.01 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  37.2 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  43.88 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  41.01 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  43.17 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  39.57 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.98 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  37.41 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  40.29 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  40.15 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.26 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.13 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.86 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  38.13 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  36.54 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  36.54 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  36.54 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  36.54 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  36.54 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  36.54 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.3 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  39.57 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  36.99 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.26 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  35.9 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.97 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  35.98 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  38.85 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  38.85 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  37.76 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  39.01 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.86 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  38.13 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4671  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.46 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0128148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.06 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  35.44 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.67 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.268467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>