178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0653 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.15 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  40 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.86 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.69 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.69 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.17 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.88 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  35 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  39.23 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.8 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.11 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.82 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.75 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  29.63 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  28.15 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.12 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  28.89 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  28.24 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.42 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  24.81 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.8 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  26.56 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.5 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.97 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.97 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.62 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.98 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.87 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  25.78 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.58 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  32.03 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  26.56 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.19 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.7 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  27.01 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  30.23 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.32 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.58 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.35 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  25.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  25.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  25.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  25.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  25.38 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.76 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.8 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.17 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  27.56 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  30.16 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.35 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.92 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  24.6 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  24.8 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.86 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  24.84 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  24.84 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  25.74 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  23.08 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  28.12 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  27.91 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  28 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.81 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  28 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>