206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3250 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 134 aa  277  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  96.27 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  96.3 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  96.3 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  86.57 
 
 		 134 aa  228  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2962  flagellar basal body rod protein FlgB  85.82 
 
 		 134 aa  226  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1416  flagellar basal body rod protein FlgB  85.82 
 
 		 134 aa  226  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3100  flagellar basal body rod protein FlgB  85.82 
 
 		 134 aa  226  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2947  flagellar basal body rod protein FlgB  85.82 
 
 		 134 aa  226  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  75.56 
 
 		 132 aa  209  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  74.81 
 
 		 132 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  74.07 
 
 		 132 aa  207  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  74.07 
 
 		 132 aa  205  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  70.37 
 
 		 132 aa  203  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  71.64 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  64.93 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  50.38 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  48.51 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  51.45 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  51.08 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  50.71 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  50.37 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  50.36 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  49.62 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  48.2 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  48.28 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.06 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  50.72 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  41.67 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.04 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  46.72 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  48.23 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  47.06 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  41.78 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.04 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.75 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.6 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.41 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  45.86 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  45.86 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.79 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  37.84 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  36.71 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  44.36 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4671  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.04 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0128148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  44.12 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  42.11 
 
 		 116 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  39.85 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.65 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.792834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  43.38 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  43.38 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.85 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  39.85 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.31 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  42.31 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.31 
 
 		 139 aa  95.9  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  42.11 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  44 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.31 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.35 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  42.42 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.42 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  41.84 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.81 
 
 		 124 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.91 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.91 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.57 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.76 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  40.43 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  40.71 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  40.29 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  40.29 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  38.3 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  40.29 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  40 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  40 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  39.23 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.68 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.75 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.75 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>