152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0462 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 134 aa  270  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.53 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.59 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.97 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.94 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.2 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.65 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.84 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.81 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  39.52 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.32 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.72 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  39.02 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.88 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.84 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.1 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.88 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  38.3 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.16 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.69 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.72 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.43 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.19 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.35 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  35.38 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  33.85 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  34.11 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.11 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.86 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.15 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.65 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.59 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  33.08 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.85 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  29.75 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  32.84 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  26.76 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  30.97 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.29 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.5 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  33.6 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  30.97 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  28.87 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2268  flagellar basal body protein  29.55 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  26.06 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.91 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  28.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  28.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  28.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0169  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  28.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  28.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.86 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  27.14 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  27.14 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  27.14 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  28.17 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  26.61 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  28.45 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  22.44 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.46 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  26.97 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.46 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.13 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  26.61 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  25.6 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.9 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.2 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  26.61 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.11 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  26.97 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  27.66 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.81 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  26.55 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  28.37 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.03 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>