50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2268 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2268  flagellar basal body protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.33 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.96 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  35.9 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.76 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  30.4 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.95 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  29.32 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.87 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.94 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  32.41 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.02 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.13 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.93 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  30.89 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  26.28 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.66 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.54 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  25.98 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.38 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.66 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  29.01 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.4 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.81 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.75 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.12 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.52 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.32 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  34 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.62 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  26.72 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.75 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  28.24 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.2 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  34.21 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.91 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.71 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.62 
 
 		 133 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 133 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>