149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1647 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  55.65 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.21 
 
 
115 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.57 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 
113 aa  107  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.7 
 
 
113 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.62 
 
 
118 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.39 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  33.94 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.03 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.61 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.65 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.6 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.51 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.86 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.5 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  33.93 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  33.93 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  36.84 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  36.84 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  31.71 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  33.93 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2268  flagellar basal body protein  32.76 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.4 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  29.2 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  28.69 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 
132 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  29.25 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.54 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.2 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.65 
 
 
133 aa  50.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.48 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  33 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.91 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  27.52 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.82 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.23 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.16 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.95 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.96 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  29.03 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  33.94 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.23 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
135 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
135 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.84 
 
 
144 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  25.93 
 
 
136 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.23 
 
 
138 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 
132 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  26.56 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  28.23 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  27.1 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.23 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.35 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.54 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  27.05 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  28.07 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  32.73 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1416  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.12 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.5 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2962  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52567  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3100  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.97 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.41 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2947  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>