158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0762 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  45.45 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.52 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.59 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.04 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.57 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.72 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  39.42 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.53 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.07 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  32.76 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.75 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.17 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.19 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.66 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.53 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  36.28 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.23 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.75 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.23 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.95 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  36.73 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.91 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.86 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.63 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  33.96 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  26.45 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.45 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.76 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  30.58 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  46.77 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  53.85 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  33.33 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.82 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  43.59 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  30.97 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  43.59 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  43.59 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.15 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  43.59 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  43.59 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  48.48 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.27 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  30.56 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.2 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.88 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  29.27 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  28.97 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  38.1 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.6 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.08 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  56.41 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3229  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.18 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.45 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.86 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  26.17 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.91 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  56.41 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.69 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  35.14 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.86 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  48.98 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  30.16 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  30.1 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.71 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  28.97 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  29.27 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  30.48 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  30.48 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  28.97 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>