120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1212 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  39.71 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.34 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.13 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  35.09 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.2 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.62 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.34 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.19 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.58 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  31.34 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.28 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.69 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.48 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.28 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.98 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.13 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.5 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.24 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.06 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.82 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  32.35 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  28.15 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.77 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  27.97 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  40.28 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  32.04 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.22 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.56 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  40.28 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  28.23 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.7 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.56 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  33.72 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  33.01 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  32.56 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.88 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  32.56 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  30.91 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.12 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.23 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  36.11 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  34.72 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  25.6 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  25.6 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  25.6 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  25.6 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  25.6 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.11 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.39 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.43 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.03 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.82 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  32.18 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.43 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  31.3 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  32.84 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  31.88 
 
 		 164 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>